薩迦派是十一世紀後期滾嘎寧布所創立，以新譯的密教經典來改革寧瑪派的教法，1073年在薩迦地方建立薩迦寺，逐漸形成薩迦派，因供奉本尊湎喜金剛有青、白、紅等三面色，寺院牆壁也塗上此三色線條，故俗稱花教。薩迦派在元明時代極甚，寺廟遍及前後藏及蒙古、漢地。此派學說是以清辨系的中觀思想，作為解釋密乘的本義，以顯乘的菩薩五位（資糧、加行、見、修、究竟）與密乘四部（作、修、瑜伽、無上瑜伽）對合而修，以菩薩智慧本性光明照耀而入大樂定，達到顯密融合的境界）。其修行次第先顯後密，因偏重不同，後來發展出顯教兩個系統與密教三個支派，密教三支派，為俄爾欽袞噶桑波創立的俄爾派，圖敦袞噶南傑創立的貢噶派，擦爾欽羅賽嘉措創立的擦爾派。
前弘期的薩迦派主要集中在十五世明珠仁波切，同時具有格魯派與薩迦派的傳承，格魯派師承自赤江仁波切、林仁波切、達賴喇嘛、格賴仁波切等，薩迦派師承自祿頂堪仁波切、阿旺列巴仁波切、德松仁波切等，1959年明珠仁波切與少數流亡海外藏胞，以康巴族抗暴軍名義赴台安頓，當時僅二十四歲，後曾擔任蒙藏委員會專門委員，在政治大學邊政研究所教授藏文，在總統所賜的天母官邸對前來請法者隨機示教，1974年成立格賴精舍弟子才漸漸增多。1980年應美國藏傳佛教中心邀請赴美弘法，移民美國，但每年會回台灣弘法，1983年弟子們成立西藏佛教會，1988年成立天母明珠精舍，1990年成立漢藏學會，1995年為了興建菩提講堂，成立中華菩提學會，1997年雲林縣林內鄉白馬山菩提講堂落成擔任首任主持。
1983年起薩迦派的法王與仁波切紛紛來台設置道場，各自以自己的法脈上師為主，彼此間無統一的規劃與聯繫。最早來的是德松仁波切，由明珠仁波切陪侍與翻譯，傳授觀世音菩薩儀軌與時輪金剛等法。同年薩迦教主達欽仁波切首次來台，後數度應蒙藏委員會邀請來台代表海外藏胞參加十月慶典，在圓山飯店傳授摧魔金剛手與五路財神等法，1987年於台北若水精舍首傳薩迦大法喜金剛大灌頂於25人。薩迦派崔津法王相當重視在台的宣教活動，派薩迦佛學院院長堪布阿貝仁波切代表來台，在台北、彰化等地成立中心，為了日後喇嘛來台登記的方便，成立了台灣薩迦總會。1987年堪布蔣陽西祿繼承德松仁波切遺願來台長住三年，配合百尊大灌頂講授釋迦心法四個月，後又傳廿一度母、五路財神、薩迦十三金法等，多次應邀赴台中、台南等地傳法。三世宗薩欽哲仁波切，自1985年起多次來台，以演講活動為主，能針對當代密宗一些不正常現象與問題提出批判，頗受歡迎，1988年傳授喜金剛大灌頂。崔津法王親自來台舉行大型傳法活動，如1999年4月在台北市國際會議廳大會堂授菩薩戒、阿彌陀佛灌頂、普巴金剛灌頂與禪觀講授，有二千多人參加。
薩迦派三大支派的教主與仁波切也紛紛來台，尋求發展，也有相當不錯的弘法成績。一、俄爾支派，或譯為哦巴支派，其長老塔立仁波切於1988年底來台，傳授喜金剛大灌頂等法，其中心道場迅速地在台北、板橋、台中、高雄等地成立，活動力大且能持續經營，如台北市建國北路的薩迦雅典弘法中心與中國藏密薩迦佛學研究會，高雄市的薩迦大慈佛學會，塔立仁波切於1998年5月圓寂。哦巴支派的教主祿頂堪仁波切於1992年首度來台，傳授長達四十天的道果教授，1998年3月至5月舉行大型的道果教授，有二百五十位弟子參與，後在台北市德行東路成立薩迦耶旺傑千弘法中心，派興給喇嘛常駐。二、擦爾支派，或譯為察巴支派，教主究給崔欽仁波切多次來台弘法，成立薩迦福樂圓滿佛學會，1999年初舉行大型的時輪金剛法會，有四千多人參加。三、貢噶支派，或譯為諾巴支派，其法王德遍仁波切1969年在英國傳法，後返俗結婚定居法國，建立諾爾旺遍德林佛學中心，1989年來台後長期居留台灣，除設立佛法中心外，著手整理密藏典籍。
薩迦派在傳法的過程中也有台籍的居士或法師，獲得「堪布」、「格西」等學位，如台中市佛陀禪院的主持堪布艮嘎希勒為台籍人士，也有獲得「阿闍黎」、「仁波切」等證書，如台北市林森北路薩迦欽列君嘉法輪中心住持伽光阿闍梨，也為台籍人士。薩迦貢噶佛教中心的主持貢噶學珠丹增仁波切，俗名林文秋，為顯教法師，法名明性，具有堪布資格。台中市聖德禪寺的聖輪法師，俗名楊贊儒，原為鸞堂的正乩與住持，潛心修密，1993年11月在印度薩迦派法王授與金剛阿闍黎灌頂，得到金剛上師的法位，法名為貢噶仁千多杰金剛阿闍黎，獲得「金剛阿闍黎傳承法位證書」與「千手觀音法寶」，1996年底在印度接受法王為期三個月的密續大灌頂，由其根本上師崔津法王授權其總戒師碌頂堪仁波切，為其剃度，受具足戒。1998年碌頂堪仁波切到台北海天禪寺主持頒授法位儀式，授與仁波切法位。
